数字生物学研讨会顺利召开

2024-02-04

从基因组学到合成生物学，生命科学正在经历范式变革，飞速发展，日新月异。AlphaFold开启了数字生物学的新纪元，一个新的技术奇点正在诞生。上海市生物工程学会于2月1日上午举办“数字生物学”研讨会，就数字生物学这一主题展开讨论。

第二位报告人复旦大学生命科学学院吕红研究员介绍了该课题组在数字细胞的构建方面的探索，包括数字细胞的构建框架，以及基于ChatGPT3.5构建酵母知识库和知识图谱的进展情况，并提出未来的需求，如需要能预测细胞自我进化的软件、需要与相关算法人员加强合作等。

第三位报告人中国科学院上海营养与健康研究所生命科学信息中心的熊燕书记/研究员从发展历程梳理指出人工智能推动迈向“数字生物学”时代，以AI制药等领域的战略布局、产业图谱等为例，分析数字生物学发展现状，并从未来应用场景、创新生态等角度展望数字生物学未来发展趋势。

第四位报告人上海微观纪元数字科技有限公司CEO耿威基于该公司的业务，从量子计算角度介绍了现阶段国内在量子化学领域的现状，并介绍该公司在数字生物学领域的相关探索和实践，指出量子计算、化学、生物学和计算机科学等相关学科背景的人员要开展数字生物学合作研究，需要将问题转化成数学问题，运用数学这一通用语言来加强沟通与合作。

第五位报告人浙江大学王宝俊教授作了题为“数据驱动的合成生物学”报告，从合成生物学研究新范式入手，介绍了该团队开发的浙江大学合成生物学自动化装置-iBioFoundry，详细介绍了该装置的AI+自动化、自动化实验、三轮测试等功能，并用相关案例进行了验证。

第六位报告人上海交通大学洪亮教授介绍了该团队利用人工智能设计蛋白的理论探索和实践案例。实践案例包括T7RNA聚合酶、某糖基转移酶、大模型挖掘塑料降解酶等，指出在利用AI进行设计时，向自然界已有的高精度学习很重要，并总结分析了AI大模型助力蛋白质工程的优势等。

第七位报告人上海智峪生物科技有限公司CEO王晟基于该公司的业务，介绍了基于蛋白结构的高速建模实践，介绍了该公司开发的相关软件和算法及其应用，及与深圳合成生物研究重大科技基础设施等的合作情况。

第八位报告人华东理工大学王喆教授从ChatGPT概述、生物医药领域的大模型，以及该团队开展的汽车领域的大模型应用三个方面进行了介绍，通过理论与实践相结合，给与会人员带来启发。

第九位报告人上海生物工程学会理事长、华东理工大学教授魏东芝以题为“数字生物学启动工作的思考”进行了交流报告。该报告从数字分子（生物催化剂创制）、数字细胞（细胞工厂创制）、数字反应器（生物过程工程强化）三个方面进行了思考，并结合该团队的研究实践进行了案例介绍。

人划线